Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atxn3Q9CVD2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atxn3Q9CVD2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atxn3Q9CVD2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms