Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2Q9CQP2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms