Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znhit3Q9CQK1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms