Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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