Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim12aQ99PQ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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