Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pcgf6Q99NA9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pcgf6Q99NA9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.3 ms