Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BrapQ99MP8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BrapQ99MP8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms