Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp4Q99ME9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms