Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprtQ99M80 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprtQ99M80 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprtQ99M80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
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