Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99M08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99M08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99M08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99M08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99M08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99M08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99M08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99M08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99M08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99M08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99M08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99M08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99M08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q99M08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q99M08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q99M08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q99M08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q99M08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q99M08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q99M08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q99M08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q99M08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q99M08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q99M08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q99M08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q99M08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q99M08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q99M08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q99M08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q99M08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms