Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smtnl1Q99LM3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smtnl1Q99LM3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms