Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Sh3bp5lQ99LH9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3bp5lQ99LH9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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