Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SardhQ99LB7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SardhQ99LB7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms