Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SmagpQ99KC7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SmagpQ99KC7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SmagpQ99KC7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SmagpQ99KC7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SmagpQ99KC7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmagpQ99KC7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms