Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TirapQ99JY1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TirapQ99JY1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TirapQ99JY1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms