Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krcc1Q99JT5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms