Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xrcc4Q924T3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc4Q924T3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms