Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NelfcdQ922L6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NelfcdQ922L6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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