Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cts3Q91ZD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms