Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc1Q91Z38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms