Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha7Q91Y13 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms