Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc44a4Q91VA1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc44a4Q91VA1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc44a4Q91VA1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms