Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SfpqQ8VIJ6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms