Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk4Q8VEJ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk4Q8VEJ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dkk4Q8VEJ3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms