Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg8Q8VE18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms