Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3il1Q8VDV3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3il1Q8VDV3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab3il1Q8VDV3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms