Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ApobrQ8VBT6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ApobrQ8VBT6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms