Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg10Q8R1P4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms