Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cdk5rap2Q8K389 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk5rap2Q8K389 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms