Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ssh3Q8K330 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms