Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Habp2Q8K0D2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Habp2Q8K0D2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms