Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip10Q8CJ53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms