Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nupl2Q8CIC2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms