Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbm28Q8CGC6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm28Q8CGC6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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