Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E4f1Q8CCE9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E4f1Q8CCE9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms