Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB59

Fam161b, Protein FAM161B, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam161bQ8CB59 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam161bQ8CB59 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam161bQ8CB59 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms