Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930507D05RikQ8C9C9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms