Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf12Q8C8K3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms