Protein–RNA interactions for Protein: Q8C898

C130026I21Rik, RIKEN cDNA C130026I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C130026I21RikQ8C898 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C130026I21RikQ8C898 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C130026I21RikQ8C898 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C130026I21RikQ8C898 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms