Protein–RNA interactions for Protein: Q8C636

Spata16, Spermatogenesis-associated protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata16Q8C636 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata16Q8C636 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata16Q8C636 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata16Q8C636 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms