Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc60Q8C4J0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc60Q8C4J0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc60Q8C4J0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc60Q8C4J0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc60Q8C4J0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc60Q8C4J0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc60Q8C4J0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms