Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf428Q8C1M2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Znf428Q8C1M2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf428Q8C1M2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms