Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem87aQ8BXN9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem87aQ8BXN9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87aQ8BXN9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms