Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Cldn17Q8BXA6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cldn17Q8BXA6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn17Q8BXA6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn17Q8BXA6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn17Q8BXA6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cldn17Q8BXA6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn17Q8BXA6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Cldn17Q8BXA6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Cldn17Q8BXA6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Cldn17Q8BXA6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Cldn17Q8BXA6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn17Q8BXA6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn17Q8BXA6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn17Q8BXA6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn17Q8BXA6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn17Q8BXA6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms