Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV8

A530064D06Rik, Plasmacytoid dendritic cell-specific receptor, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530064D06RikQ8BNV8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530064D06RikQ8BNV8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A530064D06RikQ8BNV8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms