Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik4Q8BMF5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms