Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmem260Q8BMD6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem260Q8BMD6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms