Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp1Q8BJQ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp1Q8BJQ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms