Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Srgap3Q812A2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Srgap3Q812A2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srgap3Q812A2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms