Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zer1Q80ZJ6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zer1Q80ZJ6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms